通常在治疗早期发生，部分存在剂量相关性，常见不良反应有恶心、呕吐、头痛、虚弱、出汗、嗜睡、失眠、头晕、神经质、口干、焦虑、厌食、体重下降、皮疹、男性射精异常或阳萎。较少发生的不良反应有心动过速、血压升高及肾功能异常、血清胆固醇轻度升高、视力模糊、可逆性骨髓抑制。

1.有躁狂史和癫痫的患者应慎用本品。癫痫发作应停用本品。 
2．有心脏病、高血压及甲状腺疾病、血液病患者应慎用本品。 
3．有中等肝硬化的患者，应降低50%的剂量，有轻度到中度肾损害的病人，每日剂量降低25%。 
4．18岁以下及老年患者服用本品应小心。 
5．目前尚无有关和电休克联合治疗的经验。 
6．用药期间避免饮酒。 
7．停药时应逐渐减小剂量，已应用本品6周或更长时间，应在两周内逐渐减量。 
8．妊娠和哺乳期：动物研究表明，本品无任何至畸性，也无胚胎毒性，但妊娠期服用本品的安全性尚未确定。因此妊娠期或哺乳期妇女不宜服用，除非医生认为利大于弊时方可使用。 
9.驾驶/操纵机器：临床证明，服用本品，对认知功能或精神活动没有影响，然而与所有精神类药物一样，病人在驾车或操纵机器时，小心谨慎。 
10．药物相互作用：本品与单胺氧化酶抑制剂合用将产生严重的甚至是致命的副作用。使用单胺氧化酶抑制剂的患者需停药14天后方可使用本品，使用本品的患者需停药7天后方可使用单胺氧化酶抑制剂。本品与甲氰咪呱合用，可使文拉法辛清除率降低。本品对细胞色素P450ⅡD6酶有弱的抑制作用，因此有和其他通过此酶代谢的药物发生相互作用的可能。 
11.过量用药的处理：本品没有特异的解毒药，如服用过量，可按其它抗抑郁药物过量的常规方法治疗，可应用活性碳、诱吐、洗胃等。由于文拉法辛盐酸盐有较大的分布容积，强迫利尿、透析、输血和交换输血等治疗方法益处不大。